Ο Ιωάννης Αρμακόλας, PhD (Cantab), είναι Αναπληρωτής Καθηγητής Συγκριτικής Πολιτικής της Νοτιοανατολικής Ευρώπης στο Τμήμα Βαλκανικών, Σλαβικών και Ανατολικών Σπουδών του Πανεπιστημίου Μακεδονίας και κύριος ερευνητής & Επικεφαλής του Προγράμματος Νοτιοανατολικής Ευρώπης στο Ελληνικό Ίδρυμα Ευρωπαϊκής & Εξωτερικής Πολιτικής (ΕΛΙΑΜΕΠ).
Είναι μέλος του think tank Europe‘s Futures του Institute for Human Sciences–Vienna και του Erste Foundation, καθώς και Editor του “Political Trends and Dynamics“, του περιφερειακού περιοδικού του Friedrich Ebert Stiftung– Dialogue Southeast Europe (FES SOE, Sarajevo), Editor της εκδοτικής σειράς “Southeast European and Black Sea Series“, από τον εκδοτικό οίκο Routledge, και Associate Editor της επιστημονικής επιθεώρησης “Southeast European and Black Sea Studies” (Routledge Journals, Taylor & Francis).
Διατελεί μέλος της Ομάδας Εργασίας για τη σύσταση του Διμερούς Γραφείου Συνεργασίας Νέων μεταξύ Ελλάδας και Βόρειας Μακεδονίας, βάσει της Συμφωνίας των Πρεσπών.
Έχει μεταξύ άλλων, διατελέσει ESRC Fellow στο Τμήμα Πολιτικής Επιστήμης και Διεθνών Σχέσεων του Πανεπιστημίου της Οξφόρδης, Research Fellow στο Nuffield College του Πανεπιστημίου της Οξφόρδης, Διευθυντής Έρευνας στο ʽUS– Greece Task Force: Transforming the Balkansʽ (κοινό έργο του Ελληνικού Κέντρου Ευρωπαϊκών Μελετών και του Center for Strategic and International Studies της Washington), Region Head for South East Europe στην εταιρία Oxford Analytica, Tip OʼNeill Fellow in Peace and Conflict Studies στο ερευνητικό ινστιτούτο INCORE (Ulster University & United Nations University) στη Βόρεια Ιρλανδία. Ο Ιωάννης Αρμακόλας έχει συμμετάσχει επί μακρόν ως σύμβουλος σε προγράμματα της Υπηρεσίας Διεθνούς Ανάπτυξης των Ηνωμένων Πολιτειών (USAID), του Βρετανικού Υπουργείου Διεθνούς Ανάπτυξης (DFID), του Friedrich Ebert Foundation (FES) και του Open Society Foundations στα Δυτικά Βαλκάνια, καθώς και σε εταιρείες όπως η KPMG Consulting Inc, η BearingPoint, και η Coffey International.