Στο σύγχρονο διεθνές περιβάλλον, η παγκόσμια, διεθνής, περιφερειακή και εθνική ασφάλεια συνδέονται στενά και επηρεάζονται από διάφορες τάσεις και κινητήριες δυνάμεις.
Σε μια προσπάθεια διερεύνησης και καλύτερης κατανόησης της δυναμικής της παγκόσμιας και περιφερειακής ασφάλειας, ιδίως στις νοτιοανατολικές και βόρειες γειτονικές χώρες της Ελλάδας, περιοχές αυξημένης ρευστότητας και αστάθειας, το ΕΛΙΑΜΕΠ εγκαινίασε προγράμματα σε θέματα όπως: ο ρόλος της ΕΕ στα Δυτικά Βαλκάνια και τη Μεσόγειο, οι σχέσεις μεταξύ Δύσης και Ρωσίας, οι διατλαντικές σχέσεις, η επίλυση συγκρούσεων στη Μεσόγειο και τη Μέση Ανατολή, ζητήματα ενέργειας, οι εξελίξεις στις περιοχές γύρω από τη Μαύρη Θάλασσα, η διεθνής τρομοκρατία και οι προσπάθειες πρόληψης της ριζοσπαστικοποίησης.
Κεντρικά ζητήματα για την ελληνική εξωτερική πολιτική και πολιτική ασφάλειας, όπως τα ελληνοτουρκικά, το Κυπριακό και οι σχέσεις με τη Βόρεια Μακεδονία, διατηρούν υψηλή προτεραιότητα στην ερευνητική ατζέντα του ΕΛΙΑΜΕΠ, με σαφή προσανατολισμό στην εφαρμοσμένη πολιτική.